Conţinut
- Avantaj: sensibilitate
- Avantaj: specificitate
- Dezavantaj: predispus la rezultate false sau subiective
- Dezavantaj: cost ridicat și cerere tehnică
Western blot, o tehnică analitică folosită pentru identificarea unei proteine specifice într-un eșantion dat, folosește capacitatea unei enzime sau a unui anticorp primar marcat cu fluorescență de a se lega de antigenul său specific. Este un proces în trei etape care începe cu electroforeza în gel, urmată de blotarea membranei și sondarea cu anticorpi. Detectarea proteinelor poate fi directă sau indirectă, acesta din urmă folosind un anticorp secundar marcat îndreptat împotriva primarului. Deși acceptată ca tehnică de analiză a proteinelor de rutină, western blot are limitări și beneficii.
Avantaj: sensibilitate
Unul dintre cele mai mari argumente în favoarea western blot este sensibilitatea sa. Datorită capacității sale de a detecta cât mai puțin 0,1 nanograme de proteine într-un eșantion, tehnica poate servi teoretic ca un instrument eficient de diagnostic timpuriu, sesizând chiar și cel mai mic răspuns imunogen de la un virus sau bacterii la un eșantion de pacient. În plus, această sensibilitate occidentală se bazează pe această sensibilitate din abilitatea anticorpului secundar de a amplifica intensitatea semnalului detectat de sistemul imagistic. Sensibilitate mai mare înseamnă că sunt necesare mai puține anticorpi pentru testare, ceea ce reduce costurile de laborator în mod semnificativ.
Avantaj: specificitate
Tehnica western blot își datorează specificul doi factori majori contribuitori. În primul rând, electroforeza cu gel sortează o probă în proteine de dimensiuni diferite, încărcare și conformație. Acest proces în sine este un pas uriaș spre detectare, deoarece benzile formate în gel dau deja indicii despre mărimea proteinei sau polipeptidei de interes. Specificitatea interacțiunii anticorp-antigen servește ca al doilea mare factor. Deoarece anticorpii specifici arată afinitate pentru proteine specifice, procesul poate detecta selectiv o proteină țintă chiar și într-un amestec de 300.000 proteine diferite.
Dezavantaj: predispus la rezultate false sau subiective
În ciuda sensibilității și specificității sale, un western western poate produce rezultate eronate. Un rezultat fals-pozitiv atunci când un anticorp reacționează cu o proteină neintenționată, ceea ce se întâmplă frecvent când un pacient testat pentru HIV se întâmplă să aibă tuberculoză sau o serie de infecții parazite. Un fals-negativ, pe de altă parte, poate rezulta cu ușurință dacă proteinelor mai mari nu li se oferă suficient timp pentru a se transfera corect în membrană. Blocarea și prelucrarea necorespunzătoare produc adesea benzi înclinate, decolorate sau chiar multiple, ceea ce face ca rezultatele testelor să fie supuse interpretării tehnicianului.
Dezavantaj: cost ridicat și cerere tehnică
Costul unui western blot este un compus din cheltuielile individuale mari pentru anticorpi etichetați, analiști calificați și echipamente de laborator. Un proces delicat, Western blotting necesită precizie în fiecare etapă pentru identificarea corectă a elementelor constitutive ale eșantionului. O eroare minoră în concentrația de reactiv sau în perioada de incubație poate fi dezastruoasă pentru întregul proces. În cele din urmă, echipamentele necesare pentru detectarea și imagistica - sisteme de detectare chimiluminiscente, fluorescente, radioactive sau cu laser - pot fi prea scumpe pentru unitatea medie de microbiologie.